Dlaczego tak
Warstwa bez kanału alfa nie może mieć przezroczystych pikseli, więc usunięty obszar GIMP wypełnia kolorem tła; po dodaniu kanału alfa (Warstwa → Przezroczystość → Dodaj kanał alfa) usunięte tło staje się przezroczyste. Spłaszczenie obrazu działa odwrotnie — usuwa przezroczystość. JPEG nie obsługuje przezroczystości, a tryb indeksowany ogranicza paletę.